苦手科目を克服するための補習は指名制で、基礎の徹底や定期試験対策を目的に対面で開催されます。英語は自習資料の提供から個別指導まで、学習の進捗状況に合わせて随時行われます。数学は「数学塾」が主に定期試験前の放課後に開催されています。
講習は自立・自律した学習習慣を身につけることに重きを置き、中学ではそれぞれの学習到達度に合わせた学校オリジナルのAI教材（計算力強化・英語検定対策）を使用しています。スタディサプリは中学・高校ともに利用でき、予習復習・苦手の克服、そして大学受験準備まで幅広く活用されています。AI教材とスタディサプリは学校貸与のiPadにインストールされており、学校でも家庭でも場所を選ばずに学習を継続することができます。

職員室に近接した「相談コーナー」は壁にたくさんのホワイトボードが貼られており、勉強の質問や進路相談をするときによく使われています。
休み時間や放課後には個別指導や面談のために多くの生徒が訪れ、いつも活気に満ちている空間となっています。

高校生を対象に、外部講師による大学受験準備講座を英・数・国の3教科で開講しています。高1・高2は平常授業の進度と連動させながら講座を進めていくため、無理なく受験対策を始めることができます。
高3は「共通テスト対策」など目的別に講座が設定されています。各講座とも少人数で行われるため質問がしやすく、受講者の理解度に合わせた授業が展開されます。部活動や委員会との両立が可能で、移動時間も不要。「いつもの教室」で落ち着いて受験準備に取り組むことができます。2026年度はのべ67人が参加しています。

大学生メンターが常駐する自習室で、全学年が利用できる学びの場です。学習メンターは国公立大や難関私大に通う女子大生で構成されており、毎日2～3名で個別指導や学習サポートにあたっています。平日18時まで利用することができ、入退室はご家庭に通知が届くシステムが導入されています。

長期休業中には中学生・高校生ともに本校教員による講習（希望者対象）と補習（指名制）が行われます。講座内容は授業の補いから興味関心を広げる発展的な内容までバラエティに富んでおり、部活動や委員会の予定と組み合わせながら多くの生徒が意欲的に参加しています。
聖園の教員による講習・補習の他、南山大学の模擬講義や放課後学習メンターによる講座も行われています。　

国語科夏期講習（国際子ども図書館にて）

聖園生全員が持っている学校オリジナルのスケジュール帳「聖園ノート」。予定や振り返りを日々書き込むことで、学習や生活をセルフマネジメントする力を育てていきます。別冊は教科毎に学習目標や振り返りが書き込めるようになっており、自分の成長が可視化できる工夫がされています。生徒は点数を記録するにとどまらず、学習の姿勢や取り組みを振り返って分析し、その先の学習計画を立てる際に生かしています。